La fundación FUNINDES fue creada en 1997 bajo resolución 0324 de la Gobernación del Valle del Cauca, como una entidad educativa e investigativa de carácter privado y sin ánimo de lucro, con el objeto de desarrollar, elaborar, ejecutar y administrar, planes y programas de desarrollo, educación formal y no formal e investigaciones científicas, con el fin de alcanzar el bienestar socioeconómico y cultural de la comunidad y por consiguiente la protección de los recursos naturales, en procura de un medio ambiente sano, limpio y apto para la vida.
En el año 2011, trece años después de su creación, por orden de la Gobernación del Valle fue trasladada a la Cámara de Comercio de Cali, allí se inscribió como una entidad dedicada a la investigación científica y al apoyo de planes y programas de desarrollo sostenible, eliminando la educación formal y no formal como objetivo principal.
En el año 2005 se conformó el Grupo de Investigación en Peces Neotropicales, avalado por Colciencias bajo el código COL0031753, con el cual se han desarrollado investigaciones en distintos campos de la investigación en peces de agua dulce.
Actualmente, contamos con una nueva sede en la ciudad de Cali donde tenemos laboratorios adecuados y equipados para el estudio de la fauna acuática, lo que nos permite cumplir a cabalidad con nuestra misión institucional. Adicionalmente, contamos con dos habitaciones que nos permiten recibir hasta cuatro investigadores y/o estudiantes que necesiten hacer sus investigaciones en nuestra región, teniendo todas nuestras instalaciones a su disposición.
